南昌miQP2逆转录酶
逆转录的过程:生物体中的逆转录过程就比较复杂,比如逆转录病毒(retrovirus)。病毒是真正的“极简风”,所有东西都压缩到非常。比如它的基因组中,经常有些基因是重叠、嵌套结构,充分利用每一个碱基。所以它也不会专门编码一个引发酶来合成引物,它一般是在组装时带走宿主的tRNA,在下次侵染时当作引物使用。被用作引物的tRNA会结合在病毒基因组RNA链的中间,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因组RNA两端的一段重复序列,“跳”回另一端,完成整条链的逆转录。之后水解RNA链的时候,会留下一些片段作为复制的引物。双链DNA的合成同样也需要经过一次跳跃(jump),以合成完整双链。较后两端具有相同的序列,称为长末端重复(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳跃时用来配对的序列,还有整合信号、启动子、增强子、polyA位点等重要结构。逆转录是一种将RNA反转录为DNA的生物化学过程。南昌miQP2逆转录酶
RNA逆转录实验注意事项:去除基因组DNA污染:残留的基因组DNA(gDNA)会对荧光定量结果造成很大的干扰,为了使结果更加的真实、可重复,我们需要去除gDNA干扰。我们可以在引物设计时避免gDNA的扩增,比如将上下游引物分别设在不同的外显子上;或者在提取RNA后使用DNaseI处理以除去gDNA。较后,我们还有非常法宝,选择一款具有gDNA去除功能的逆转录试剂盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆转录实验注意事项:逆转录酶热稳定性:逆转录酶在整个反转录体系中具有关键性影响。除了活性以外,逆转录酶的热稳定性同样很重要,在较高温度下进行逆转录,能够减少RNA的二级结构,增加逆转录的效率。野生型的M-MLV逆转录酶很“怕热”,高于37℃时,稳定性大幅下降。深圳茎环法逆转录供货商逆转录实验前要对反应体系进行无RNA和无反转录酶的对照。
逆转录的端粒复制:逆转录经常与细胞恶性转化有关,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆转录过程。所以相关研究可以为很多疾病的研究和防治提供帮助。逆转录酶抑制剂就一直是药物研发热点,例如抗HIV的nevirapine。逆转录酶缺乏校对(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出错。这也是很多病毒容易突变进化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不过,校对功能与逆转录活性并不矛盾。有人使用改良的定向进化策略从具有校对功能的DNA聚合酶(古细菌的DNA聚合酶B)进化出高保真的耐热逆转录酶,称为逆转录异种聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),证明校对与逆转录是兼容的。在科研中,RTX可用于RT-PCR等过程,能够提高精确度及简化操作程序。
反转录酶(reversetranscriptase,也可写成逆转录酶)又称为依赖RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中发现了一种特殊的DNA聚合酶,该酶以RNA为模板,以dNTP为底物,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-OH末端上,根据碱基配对的原则,按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链,这条DNA单链叫做互补DNA(complementaryDNA,CDNA)。反转录酶(Reversetranscriptase)是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。逆转录引物的设计需要考虑反向引物的特性。
M-MLV反转录酶比AMV反转录酶缺乏连续性,因此要获得像AMV反转录酶反应中产生同样量的cDNA就要求使用较多单位的M-MLV反转录酶。用1微克的mRNA起始合成首先条链的cDNA,要用8单位的M-MLV反转录酶才相当于1单位的AMV反转录酶的作用。该酶很容易被亚精胺(Spermidine)所抑制,该酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反转录酶5X反应缓冲液,也不能用Promega的RiboclonecDNA首先条链缓冲液,因为这二种缓冲液均含有亚精胺。逆转录实验可以选择加入RNA合成抑制剂RNAse防止RNA降解和污染,逆转录实验过程需适当的RNA质量,过少或质量不佳将影响扩增效果。逆转录的反应机理是RNA模板上的DNA合成。重庆快速逆转录试剂研发
核酸合成与转录过程与遗传信息的流动方向相反,故称为逆转录。南昌miQP2逆转录酶
逆转录实验步骤:用SSⅢ逆转录酶进行RT(20ul体积)1、准备0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暂离心。3、65℃水浴5分钟后,立刻0℃冰水浴至少1分钟。4、短暂离心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆转录酶。5、短暂离心。6、50℃水浴60分钟进行逆转录。7、70℃水浴15分钟灭活逆转录酶。8、-20℃保存,或立即进行PCR。MCERTmix含有比例优化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可从RNA转录本的各个区域起始,并具有相同的逆转录效率,较大程度保证qPCR结果的真实性和可重复性。南昌miQP2逆转录酶
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